Ту-104 — гражданский вариант бомбардировщика Ту-16 с новым герметичным фюзеляжем. Опытный самолет совершил первый полет 17 июня 1955г. и был введен в эксплуатацию в следующем году. Самолет Ту-104, вмещавший 50 пассажиров, был оснащен двумя турбореактивными двигателями Микулина АМ-3 тягой 6750 кг (14881 фунт). Мощность силовой установки позднее была увеличена за счет использования двигателей АМ-3М тягой 8700 кг (19180 фунтов), которыми также был оснащен усовершенствованный самолет Ту-104А, вмещавший 70 пассажиров. Самолет Ту-104Б с удлиненным фюзеляжем (на 1,21 м (3 фута 11,5 дюйма) со стандартным количеством пассажирских мест на 100 человек был введен в эксплуатацию 15 апреля 1959г. К моменту завершения в следующем году серийного производства было построено около 200 самолетов Ту-104 всех вариантов. Они надежно служили Аэрофлоту вплоть до 1981г. Обозначения Ту-104Д и Ту-104В были даны самолетам Ту-104А, модифицированным с целью размещения 100 и 85 пассажиров соответственно, без удлинения фюзеляжа. Шесть машин, поставленных чехословацкой авиакомпании CSA, были в основном самолетами Ту-104А, вмещавшими 81 пассажира.

Небольшое количество самолетов Ту-104 использовалось ВВС для тренировки космонавтов и перевозки персонала. Один с заостренным носом использовался в качестве самолета метеоразведки. Вариант Ту-104Е использовался для установления рекорда полета по замкнутому маршруту протяженностью 2000 км (1230 миль) с полезной нагрузкой 15 тонн. В отчетах НАТО самолет Ту-104 обозначался как Camel. По крайней мере, один самолет был переделан на сборочной линии в качестве опытного образца модели Ту-110 с четырьмя двигателями в корневой части крыла. Он был предназначен для ВВС после отказа от него Аэрофлота, несмотря на его высокую экономичность, удовлетворение требованиям размеров ВПП, хорошие летные характеристики и характеристики управляемости.